Saffieren gaan bovenal over kleur en dit maakt het de belangrijkste factor als het gaat om waarde. Andere factoren zijn karaat, insluitsels, transparantie, slijpsel, tekenen van behandeling (en) en kleurverzadiging.

Saffieren hebben minder insluitsels dan robijnen of smaragden maar saffieren zonder insluitsels zijn nog steeds zeldzaam. Dit betekent nog steeds dat insluitsels invloed hebben op de waarde van een saffier, er zijn gewoon meer saffieren met niet zo veel insluitsels. Eén type insluitsel kan een positieve uitkomst hebben op de waarde en dat is zijde, een zeer subtiele vorm van rutielnaalden. Het veroorzaakt ook het asterisme (ster)-effect in cabuchon geslepen saffieren.

Verwarming is een van de belangrijkste behandelingen die saffieren ondergaan en wordt voornamelijk gedaan om de kleur van de edelstenen naar voren te brengen. Het heeft een serieuze impact op de waarde door het bijna in twee te snijden. Verhitting met residu laat de prijs achter op een derde van een natuurlijke onbehandelde saffier en andere behandelingen zoals het vullen met kobalt-loodglas maken de saffier praktisch waardeloos.

Saffieren zijn te vinden in veel verschillende kleuren, die niet blauw zijn, worden fancy saffieren genoemd. Fancy saffierkleuren zijn groen, oranje, roze, paars en geel. Er is ook een combinatie van roze en oranje padparadscha. Deze vorm is zeer strikt gebonden aan een bepaalde tint in kleuren die variëren van licht tot medium roze-oranje tot oranje-roze. Padparadscha-saffieren zijn zeer zeldzaam en dus als bijgevolg zeer waardevol.